Examen bactériologique d'une prélèvement oculaire
Plan du chapitre
1 - Contexte
1 - Infections oculaires
2 - Examen préopératoire
2 - Objectifs
3 - Prélèvements
4 - Transport
5 - Examen direct
6 - Culture et antibiogramme
1 - Prélèvements préopératoires
2 - Autres prélèvements
3 - Antibiogramme
1 - Contexte
Le laboratoire de microbiologie est amené à intervenir dans le diagnostic des infections oculaires
à deux niveaux :
* isoler l'agent causal d'une infection avérée
* participer à la prévention des infections post-opératoire en étudiant la flore conjonctivale.
1 - Infections oculaires
Deux éléments du contexte de la survenue des infections oculaires sont déterminants pour définir
la marche à suivre au laboratoire :
* la localisation de l'infection
* le contexte épidémiologique de survenue de cette infection.
- Localisations
Les infections oculaires s'observent :
* au niveau du segment antérieur
- conjonctivites
- kératites
- uvéites antérieures ou iridocyclites
* au niveau du segment postérieur
- choriorétinites et rétinites
- endophtalmies et panophtalmies, véritables urgences médico-chirurgicales
- infections périoculaires.
- Contexte épidémiologique
L'étiologie des infections oculaires peut varier avec :
- le terrain : âge, immunodéficience,
- l'origine géographique du patient,
- séjours en zones d'endémie filarienne.
2 - Examen préopératoire
L'examen bactériologique pré-opératoire est basé sur le fait qu'un pourcentage important des infections
après chirurgie du globe oculaire se développe à partir des bactéries présentes sur la conjonctive avant
l'intervention.
2 - Objectif s
L'examen bactériologique d'un prélèvement oculaire va :
* apporter le diagnostic étiologique de l'infection en isolant et identifiant l'agent bactérien ou
mycosique responsable,
* guider la thérapeutique,
* prévenir les infections postopératoires.
Les principaux agents potentiellement pathogènes à mettre en évidence sont regroupés dans les tableaux
ci-après
Tableau 1 : Bactéries habituellement isolées dans les prélèvements conjonctivaux préopératoires
Potentiellement Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae,
Bactéries à Gram + pathogènes Enterococcus faecalis
Commensaux Staphylococcus epidermidis, Corynebacterium sp,
Propionibacterium acne, Streptococcus spp
Potentiellement Entérobactéries (Serratia, Klebsiella, Proteus, Enterobacter)
Bactéries à Gram - pathogènes Pseudomonas aeruginosa, Haemophilus, Moraxella,
Acinetobacter
Commensaux Moraxella catarrhalis, Neisseria spp
Tableau 2 : principaux micro-organismes responsables d'infections oculaires
Localisations Contexte habituel (ou par défaut) Contextes particuliers
Conjonctivite S, aureus, S. pyogenes, S. pneumoniae, Adulte inimunodéprimé
H. influenzae, N. gonorrhoeae, Pseudomonas, Entérobactéries, levures Entérobactéries, Moraxella spp Nourrisson et petit enfant: N. gonorrboeae, S. aureus, S. pyogenes, C. trachomatis,
P. aeruginosa.
Afrique et pays en voie de développement : M. tuberculosis, C. diphtheriae, N. gonorrhoeae,
Haemopbilus aegyptius. Chlamydia trachomatis.
Cellulite S. aureus, S. pneumoniae, Enfant < 5 ans. H. influenzae
orbitaire aiguë P aeruginosa, S, pyogenes Immunodéprimé ou diabétique bactéries anaérobies et levures
Cellulites en plus des germes ci-dessus :
orbitaires chroniques Mycobacteilum, Nocardia, Actinomyces,
Aspergillus.
Dacryoadénites Aiguë : S. aureus, S. pyogenes, Chroniques : Nocardia, M. tuberculosis. et dacryocystites S. pneumoniae, H. influenzae. M. Ieprae, T. pallidum, levures
Canaliculite Propionibactérium propionicus
Blépharites S. auréus et surtout S. epidermitidis, Demodex
parfois Moraxella spp,
Kératites S. aureus, S.pneumoniae, Porteurs de lentilles : amibes libres
P. aeruginosa, Klebsiella, Enterobacter, Acantbamoeba, Naegleria
Serratia, Citrobacter, Proteus.
Parfois : mycobactéries atypiques,
levures, Aspergillus.
Endophtalmies Mêmes germes que les kératites,
avec en plus Neisseria meningitidis,
Bacillus cereus, entérocoques, SCN et certaines levures.
3 - Prélèvements
Les prélèvements bactériologiques oculaires concernent essentiellement les prélèvements conjonctivaux :
* soit pour un examen préopératoire, le prélèvement doit alors être réalisé immédiatement avant
l'intervention chirurgicale
* soit pour diagnostiquer une conjonctivite, le prélèvement sera effectué :
- avant toute toilette faciale
- au niveau de l'angle interne de l'oeil
- avec un tampon stérile monté très serré
Plus rarement le prélèvement sera demandé dans le cadre :
* d'une blépharite; on prélèvera alors les croûtes palpébrales et un ou deux cils à la pince à épiler stérile.
* d'un orgelet qui sera ouvert avec un vaccinostyle stérile pour prélever le pus (à la pipette ou à l'écouvillon).
* d'une dacryocystite qui demande un recueil du pus au niveau des points lacrymaux palpébraux
après pression sur les sacs lacrymaux;
* d'un ulcère de cornée, le prélèvement est alors effectué avec un coton monté après anesthésie locale.
Les prélèvements intra-oculaires ou péri-orbitaires ainsi que les trois derniers sont du domaine de l'ophtalmologiste.
4 - Transport
-
Chaque fois que l'examen ne peut être fait extemporanément un milieu de transport adapté au contexte
devra être utilisé :
* milieu pour Chlamydia,.
* milieu de type Stuart pour les autres bactéries.
5 - Examen direct
L'examen direct n'a pas d'intérêt pour les prélèvements avant chirurgie oculaire.
Pour les autres prélèvements, deux frottis peuvent être réalisés :
- le premier pour la coloration de Gram qui permettra de décrire la flore dominante;
- le deuxième pour une coloration de Giemsa à partir de laquelle l'aspect cytologique sera
étudié, en particulier la présence de polynucléaires.
D'autres frottis pourront être réalisés selon le contexte clinique et épidémiologique :
* pour mettre en évidence Chlamydia trachomatis par immunofluorescence, selon le contexte
épidémiologique;
* ou à l'état frais, des amibes libres chez les porteurs de lentilles cornéennes.
6 - Culture et antibiogramrne
1 - Prélèvements pré-opératoires
L'objectif est de mettre en évidence les bactéries pathogènes présentes dans 25 à 30 % des cas :
- les bactéries à Gram positif sont les plus fréquentes (75 à 80 %): Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis;
- de nombreuses bactéries à Gram négatif, surtout des Entérobactéries peuvent être responsables de conjonctivites : Proteus, Enterobacter, Serratia, Klebsiella, Pseudomonas aeruginosa,
Haemophilus, Moraxella spp et Acinetobacter.
Chez les porteurs de lentilles cornéennes les fréquences sont inversées : les bactéries à Gram négatif prédominent.
Les bactéries de la flore commensale, parfois très importante, n'ont que peu d'influence sur la conduite à tenir, sauf chez le sujet immunodéprimé : Staphylococcus epidermidis, Corynebacterium spp,
Propionibacterium acnes, Streptococcus spp, Moraxella calarrhalis, Neisseria spp.
* Antibiogramme
L'antibiogramme ne sera réalisé que sur les bactéries potentiellement pathogènes.
2 - Autres prélèvements
L'ensemencement des prélèvements recueillis au cours des infections oculaires doit permettre l'isolement
des agents listés dans le tableau n° 1 :
* habituellement on utilisera des géloses au sang et au sang cuit, incubées sous CO 2 à 35 °C.
* D'autres milieux peuvent être utilisés, en fonction du contexte clinique et épidémiologique :
- Les cultures cellulaires pour isolement de chlamydiae trachomatis;
- Un bouilon anaérobie et une gélose au sang en anérobiose;
- Un milieu de Sabouraud, incubé entre 22 et 30 ° C pour les levures et aspergillus;
- Des milieux de culture pour Mycobactérium et Nocardia, pendant 8 semaines à 35 ° C, sous CO 2;
- Des milieux de culture pour amibes libres.
*
Résultats attendus* Conjonctivites
Sujet sain adulte : Staphylococus aureus, Streltococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Neisseria gonorrhoeae, Entérobactéries, Moraxella spp.
Adulte immunodéprimé : Pseudomonas, Entérobacteriaceae, levures.
Nourrisson et petit enfant : Neisseria gonorrhoeae, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes,
Chlamydia trachomatis, Pseudomonas aeruginosa.
Contexte épidémiologique particulier :
( Afrique et pays en voie de développement)
- Mycobacterium tuberculosis, Corynebacterium diphteriae, Neisseria gonorrhoeae, Haemophilus aegypticus.
- Chlamydia trachomatis est responsable du trachome (sérotypes A,B, et C) et de la conjonctivite à inclusions
( séroypes D et K). Seul l'examen direct ou la culture permettent le diagnostic; la sérologie est le plus souvent
en défaut.
* Autres infections oculaires
Cellulites orbitaires aiguës : S. aureus, S. pneumoniae, P. aeruginosa, S. pyogenes,
- chez l'enfant de moins de 5 ans : H. influenzae ;
- chez le patient irnmunodéprimé ou diabétique : bactéries anaérobies et levures. pr‚lŠvements
Cellulites orbitaires chroniques, rares, post-chirurgicales :
en plus des germes ci-dessus : Mycobacterium, Nocardia, Actinomyces, Aspergillus.
Dacryoadénites et dacryocystites :
- Les glandes lacrymales sont rarement l'objet d'infections aiguës, le sac lacrymal peut s'infecter à la suite d'un blocage de l'écoulement des larmes :
- On isole : S. aureus, S. pyogenes, S. pneumoniae, H. influenzae ;
- Infections chroniques : Nocardia, M. tuberculoses, M. leprae, T pallidum et certaines levures.
Canaliculites :
Infections, surtout chroniques, de l'orifice lacrymal et des canalicules, dues en majorité à Propionibacterium propionicus.
Blépharites :
Rares, dues à S. aureus et surtout S. epidermidis, parfois Moraxella spp.
Kératites
- Possibilité de mise en évidence d'amibes libres à l'examen direct, en particulier chez les porteurs de lentilles ;
- Bactéries les plus souvent en cause :
S. aureus, S. pneumoniae, P. aeruginosa, Klebsiella, Enterobacter, Serratia, Citrobacter, Proteus ;
- Parfois : mycobactéries atypiques, levures, Aspergillus.
Endophtalmies
D'origine endogène ou exogène (post-chirurgicales ou après blessure)
Mêmes germes que les kératites, avec en plus : Neisseria meningitidis, Bacillus cereuset certaines levures.
3 - Antibioqramme
Les antibiogrammes seront réalisés sur les germes potentiellement pathogènes : les antibiotiques étudiés sont
limités.
Bibliographie
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- La Revue du Praticien, 1983, XXXIII, 37, 1947-1949.
FLANDROIS J.-P., CHOMARAT M. - L'examen bactériologique des prélèvements oculaires
- Bactériologie MédicalePratique, 1987.
SALVANET-BOUCCARA A., FORESTIER F., COSCAS G., ADENIS J.P., DENIS F.
Endophtalmies bactériennes, J. Fr. OphtalmoI., 1992, 15 : 669-678.
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