Procédure opératoire générale d'analyse d'un Liquide Céphalo-Rachidien
Procédure PF6Aq2-4
I - Prélèvement
A) Nature et identification
- LCR recueilli par ponction lombaire après fond d'oeil (pour écarter une hypertension
intracrânienne, contre indication formelle à la PL)
- Identification nominative sur les tubes réalisée dans le service au moment du prélèvement
B) Recueil et acheminement
- Recueillir 5 à 10 ml de LCR
- Habituellement dans 3 tubes stériles successifs pour permettre de différencier hémorragie
méningée et prélèvement hémorragique :
. 1 tube est destiné à l'analyse cytobactériologique : généralement le 3ème tube reccueilli
. 1 tube est destiné à la biochimie
. 1 autre tube pour d'éventuels examens complémentaires
- Transmettre rapidement au laboratoire dans du coton cardé, pour préserver la vitalité des
germes éventuellement présents
C) Etape préanalytique
Le LCR ne nécessite un traitement préalable qu'en cas :
- de prélèvement hémorragique : centrifuger 5mn à 4000tr/mn avant de déterminer les chlorures
et la glycorachie. La valeur de la protéinorrachie est dans ce cas faussée par la présence
d'hémoglobine et de protéines plasmatiques
- de recherche d'antigène de cryptocoque : centrifuger 10mn à 4000tr/mn puis désactiver pendant
30 mn au bain-marie à 56°C
D) Etapes analytiques
Se reporter au paragraphe II - Protocole opératoire
E) Etapes postanalytiques
Conserver le LCR pour analyses complémentaires éventuelles :
- Recherche de mycobactéries, électrophorèse, dosage des immunoglobulines : conserver au
réfrigérateur à 4-8°C
- Virologie : congeler à -20°C
II - Protocole opératoire
A) Examen cytobactériologique
L'examen d'un LCR est l'une des deux véritables urgences du laboratoire de Bactériologie-Parasitologie, l'autre étant la recherche de plasmodium.
Les résultats doivent être communiqués au prescripteur le plus rapidement possible.
1) Examen macroscopique
Examiner le tube de prélèvement le plus clair et le plus rempli. Noter l'aspect macroscopique :
- Limpide, eau de roche
- Hémorragique, xanthochromique
- De légèrement trouble à eau de riz
- Purulent
2) Ensemencement
Respecter les conditions rigoureuses d'aseptie (travail à proximité de la flamme)
- Utiliser des géloses préchauffées à 37°C et ensemencer :
. 1 gélose au sang
. 1 gélose chocolat-polyvitex
- A l'aide d'une pipette Pasteur stérile déposer 3 gouttes de LCR à 3 endroits distincts sur chaque
gélose pour faciliter l'interprétation de la culture en cas de contamination
- Mettre les 2 géloses à incuber à 37°C sous CO2 jusqu'au lendemain matin
3) Cytologie
- Homogénéiser le LCR par agitation douce du tube
- Déposer 1 mm3 de LCR dans une cellule de Malassez
- Laisser sédimenter 5 mn
- Compter les éléments sur l'ensemble de la cellule à l'objectif 40 à sec
- Etablir ainsi le nombre d'hématies et de leucocytes présents par mm3
- En cas de doute pour différencier les hématies des leucocytes, on peut ajouter une goutte d'acide
acétique 0,1N sur un bord de la cellule de Malassez provoquant ainsi la lyse des hématies sans
altération des leucocytes
4) Recherches particulières
a) Recherche de cryptocoque
Cette recherche n'est justifiée que pour un patient immunodéprimé. Elle est systématique dans le
cas d'un malade VIH+.
- Technique à l'encre de Chine : suivre le protocole en annexe de la présente procédure
- Mise en évidence d'antigènes cryptococciques : suivre le protocole en annexe de la présente
procédure
b) Culture de mycobactéries
Conserver systématiquement du LCR au réfrigérateur pour transmission au laboratoire de culture
des mycobactéries
c) Culture de virus
Congeler le LCR à - 80°C après examen bactériologique en vue d'une transmission ultérieure au
laboratoire de virologie
5) Résultats
a) Examen macroscopique et cytologie
Les premiers résultats doivent être communiqués sans délai
Conduite à tenir en fonction du nombre de leucocytes par mm3 :
- N < 20/mm3 : communiquer l'aspect macroscopique , le nombre d'hématies et de leucocytes
présents par mm3 et attendre la culture pour les résultats ultérieurs
- N > 20/mm3 : préparer 4 lames pour examen microscopique :
. Déposer 3 gouttes de LCR dans 4 cônes stériles pour cytospin
. Centrifuger pendant 10 mn à 1000tr/mn sur la centrifugeuse cytospin (se reporter à la
procédure de fonctionnement et d'utilisation de la cytospin)
. Sécher rapidement les lames
. Colorer les 4 frottis : 1Gram, 1 MGG, les 2 autres frottis étant destinés aux colorations
éventuelles par le Bleu de Méthylène (pneumocoques) ou par l'Auramine (BK)
b) Examen microscopique
. Réaliser la formule leucocytaire sur le frottis MGG en comptant au moins 100
leucocytes. Signaler la présence éventuelle de cellules atypiques.
. Observer à l'immersion le frottis coloré par le Gram : rechercher la présence éventuelle
de bactéries sur l'ensemble du frottis
. Communiquer les résultats au prescripteur dès que possible
c) Culture
Les géloses sont observées le lendemain matin de leur mise en culture.
Les espèces bactériennes les plus fréquemment rencontrées en France, notamment en fonction de l'âge du patient sont mentionnées dans le tableau I.
Tableau I : Méningites bactériennes en France - Germes les plus fréquemment rencontrés
En fonction de l'âge En fonction du contexte clinique
Nouveau-né : Streptocoque B Traumatisme : Streptocoque sp
Listeria Staphylocoque sp
E coli Klebsielle
Enterobacter
Enfant : Hémophilus Serratia
Méningocoque Pseudomonas
Pneumocoque
Adulte : Pneumocoque Immunodépression : Mycobactéries
Méningocoque
Vieillard : Listeria
Pneumocoque
Attendre 24 heures au minimum pour déclarer une culture négative.
C) Examen biochimique
Se reporter aux fiches opératoires relatives aux paramètres biochimiques concernés
1) Systématiques
Conjointement, en complément à l'examen cytobactériologique, on pratique dans le LCR les dosages :
- du chlore
- du glucose
- et des protides : attention le dosage est faussé dans le cas d'un prélèvement hémorragique
(présence d'hémoglobine et de protéines plasmatiques)
L'interprétation de l'examen biologique du LCR en fonction de la biochimie et de l'examen direct cytobactériologique est résumée dans le tableau II.
Tableau II - Caractères biochimiques et examen cytobactériologique du LCR au cours des méningites infectieuses
Liquide céphalo-rachidien
Caractères
LCR normal Méningite purulente Méningite lymphocytaire
Aspect Limpide Trouble, purulent Clair ou
Eau de roche légèrement trouble
Cytologie 1-3 éléments/mm3 1000 à 2000 100 à 300
éléments/mm3 éléments/mm3
Formule Inutile Prédominance de Prédominance de
Poly-neutrophiles Lymphocytes
Glucose 3 à 4 mmol/l 0 à 1 mmol/l Normal (virus)
Abaissé (bactéries)
Protides 0.2 à 0.5 g/l 1 à 5 g/l 1 à 2 g/l
Chlorures 110 à 130 mmol/l Normal Normal sauf tuberculose
(< 110 mmol/l)
Agents
infectieux Absence Méningocoque Virus
Pneumocoque Mycobactéries
Hémophilus Brucelles Streptocoque B Leptospires
Klebsielle Tréponèmes
E. coli Borrelia
Rickettsies
Mycoplasmes
Remarques :
- Le LCR du nouveau-né contient normalement 20 à 30 éléments/mm3 dont 50% de polynucléaires ; la protéinorachie peut être supérieure à 1,5 g/l et la glycorachie entre 2 et 3 mmol/l.
- La glycorachie est toujours normale dans les méningites virales et rarement abaissée au cours des infections à spirochètes (Leptospires, Borrelia, Tréponèmes).
2) Autres paramètres
Les autres paramètres biochimiques éventuellement déterminés sur le LCR sont fonction du contexte clinique. Citons principalement :
- L'électrophorèse des protides
- Le dosage de l'albumine
- Le dosage des immunoglobulines :
. Soit dans le LCR
. Soit simultanément dans le LCR et dans le sérum du patient pour le calcul des différents
index (se reporter aux procédures relatives à ces analyses)