La MYCOLOGIE sur le Web
Glossaire
Index de mycologie
1 Apophysomyces elegans
Zygomycète de l'ordre des Mucorales,
famille des Mucoraceae.
Index de mycologie
Description
Proche du genre Absidia, il se distingue par des apophyses très marquées
en forme de vase ouvert ou de campanule.
Sporocystophores non ramifiés, isolés ou regroupés en bouquets.
Rhizoïdes réduits et présence de stolons.
L’apophyse est développée et a une forme évasée ou en forme de cloche.
La columelle est hémisphérique.
Les spores sont sub-sphériques à cylindriques.
Habitat
Issu du sol, isolé pour la première fois de la terre d'un champ de manguier en Inde.
Pouvoir pathogène
A l'origine de grands délabrements cutanés et sous-cutanés à la suite de traumatisme.
L'évolution est rapide.
Les lésions sont extensives et volontiers nécrotiques et gangréneuses.
Les autres localisations sont viscérales ( poumons, reins, muscles, os ...)
Diagnostic
Repose sur l'isolement :
examen direct et culture des prélèvements de peau, tissus sous-cutanés, biopsie
d'organes, sérosités, etc ...
L'examen direct confirme la nature parasitaire et le diagnostic de
zygomycose :
filaments mycéliens coenocytiques,
au sein d'une réaction inflammatoire hémorragique et nécrotique.
Filaments mycéliens larges, rarement septés, irréguliers, ramifiés à angle droit.
Sur milieu de Sabouraud à 25°C, culture rapidement extensive,
duveteuse, blanc-crème au départ, puis devenant chamois.
Pas de pigment au revers.
Pousse bien à 26°C à 37°C et 42°C.
- Filaments mycéliens larges, coenocytiques peu ou pas septés.
- Sporangiophores, simples, non branchés, dressés, légèrement courbés au sommet,
pouvant atteindre 500 µm de long.
- Sporanges piriformes bien distincts, présence d'une columelle et apophyse.
Repiquer sur PDA à 30°C,
sur carré de gélose puis déposer le carré de gélose dans une boîte de Pétri
contenant un peu d'eau distillée stérile avec 0,2 ml d'extrait de levures à 10 %,
incuber à 37°C.
Au bout de 8 jours, les sporangiophores se révèlent caractéristtiques. "- Absidia corymbifera: il s'en distingue par les importantes apophyses en forme de campanule.
Lorsque la sporulation fait défaut,
il est donc intéressant de repiquer sur PDA
ou sur bloc de gélose à la farine de maïs (méthode d'Ellis et Ajello).
2 Absidia corymbifera
Zygomycète de l'ordre des Mucorales,
famille desMucoraceae.
Index de mycologie
Description
- Sporange ou sporocyste piriforme avec une apophyse bien marquée :
aspect d'entonnoir caractéristique.
- Sporocystophores isolés ou ramifiés fixés au milieu des stolons.
- Rhizoïdes difficiles à mettre en évidence.
Habitat
C'est un champignon cosmopolite,
saprophyte du sol et de nombreux substrats dont des céréales (blé, orge, riz).
Pouvoir pathogène
Mucormycose à l'origine de mycoses systémiques profondes (pneumopathies ...)
et cutanées survenant volontiers chez les leucémiques, les sujets neutropéniques,
les patients diabétiques avec acidocétose,
les enfants souffrant de malnutrition protéino-calorique.
Diagnostic
Repose sur :
L'examen direct et la culture des prélèvements biologiques
(produits d'expectorations, LBA, sérosités ou pus de lésions cutanées,
biopsie, etc ...).
L'examen direct est important pour affirmer la nature parasitaire :
filaments courts entrelassés.
Tropisme du champignon pour les vaisseaux (thrombose).
Filaments irréguliers, typiquement non cloisonnés, à paroi épaisse.
Les filaments sont plus ou moins ramifiés, le diamètre oscille entre 10 et 20 µm.
Au sein d'une réaction nécrotique, granulomateuse.
Sur milieu de Sabouraud sans Actidione,
la culture a une croissance rapide
et la colonie atteint 1 cm en 48 heures à 37°C.
Cette espèce est thermophile et pousse jusqu'à 48°C.
La colonie est floconneuse, envahissant le tube ou la boîte, de couleur variée.
- Grands sporocystophores, très longs et ramifiés
formant des sortes de grappes ou corymbes.
On repère une cloison subterminale dans les sporocystophores.
- Rhizoïdes mal différenciés.
- Sporocystes de 10 à 120 µm de diamètre, piriformes, hyalins.
Diagnostoc différentiel
- Absidia glauca : ce dernier n'est pas thermophile
et ne pousse pas au-dessus de 36°C.
Les spores sont globuleuses plus ou moins arrondies.
3 Absidia glauca
Zygomycète de l'ordre des Mucorales,
famille des Mucoraceae,
Index de mycologie
Description
Sporange ou sporocyste piriforme avec une apophyse bien marquée :
l' apophyse bien marquée a un aspect en entonnoir caractéristique.
Sporocystophores isolés ou ramifiés, fixés au milieu des stolons,
indépendants des noeuds.
Rhizoïdes différenciés, difficiles à mettre en évidence.
Habitat
Champignon issu d'habitats variés :
forêt, marécages, dunes mais aussi aussi isolé dans l'air, l' eau, etc ...
Abonde en zone tempérée.
Cette espèce est habituellement un saprophyte.
C'est un contaminant des cultures.
Pouvoir pathogène
N'est pas pathogène pour l'homme.
Culture
Sur milieu de Sabouraud sans Actidione, à 25°C, la culture pousse rapidement;
elle est extensive.
Son aspect est floconneux ou cotonneux.
Blanche au départ, elle devient plus foncée ensuite, gris-vert.
Température maximum de pousse : 30°C.
Examen des cultures
Sporocystophores groupés par 2, 3 ou 4,
fixés à un mycélium aérien pouvant atteindre 1 mm de long.
Sporocystes piriformes, hyalins, grisâtres avec une apophyse marquée
(taille 30 à 60 µm).
La columelle est hémisphérique.
Une cloison subterminale est notée.
Diagnostic différentiel
Absidia corymbifera : chez ce dernier les sporocystes sont disposés en grappe
ou en corymbe et les spores sont ovales.
Par ailleurs, A. corymbifera est très thermophile, il pousse jusqu'à 48°C.
4 Cunninghamella sp
Zygomycota.
Mucorales.
Cunninghamellaceae.
Index de mycologie
Description
Le sporocystophore souvent ramifié, se termine par une vésicule ronde
portant sur de petits pédoncules des sporangioles externes,
de forme ronde ou ovale contenant une spore (sporangiospore).
5
Cunninghamella bertholletiae
Zygomycète de l'ordre des Mucorales,
appartient à la famille des Cunninghamellaceae.
Index de mycologie
Description
Sporocystophores se terminant par une vésicule globuleuse
où naissent sur des petits pédicèles des sporangioles (spores externes).
Habitat
Champignon issu du sol, se développe aussi sur diverses céréales (graines ...).
Pouvoir pathogène
Agent de mycoses profondes ou disséminées (espèce thermophile).
Responsable d'atteintes viscérales multiples : pulmonaires, cardiaques, rénales,
spléniques, digestives (oesophagiennes), favorisées par la desferoxamine.
On note aussi des atteintes sinusiennes.
Diagnostic
- Il repose sur l'examen direct et la culture à partir des prélèvements biologiques,
des produits d'expectorations,
liquide bronchio-alvéolaire (LBA),
mais aussi de tissus profonds à partir de biopsies d'organes
et de produits d'aspirations des sinus ...
Caractéristiques culturales
Hyphes irrégulières peu ou pas septées au sein de micro-abcès
entourés par un manchon éosinophile.
Il pousse bien à 37°C et jusqu'à 45°C.
La culture est rapide et extensive.
La colonie est floconneuse, de couleur blanche devenant grise.
Le revers est incolore.
Microscopie
Filaments larges, irréguliers, non septés.
Sporocytophores simples ou ramifiés dont l'extrémité se dilate
en une vésicule sphérique à ovale de taille variable (40 µm environ).
Sur ces vésicules se forment, par l'intermédiaire de fins et courts pédicules,
diverses fructifications.
Diagnostic différentiel
- Cunninghamella elegans : colonies d'emblée grises
et absence de pousse au-delà de 37°C.
- Cunninghamella echinulata se différencie par les spores fortement échinulées
(fines épines régulières pouvant atteindre 4 µm de long).
T° maximale de pousse : 25°.
6 Mortierella wolfii
Zygomycète de l'ordre des Mucorales,
appartient à la famille des Mortierellaceae.
Index de mycologie
Caractéristiques
Mycélium à ramification dichotomique.
Sporange sphérique sans columelle (celle-ci est atrophiée),
sporangiophores à colerette très marquée.
Sporangiospores produites en nombre variable, colorées en brun ou rose.
Chlamydospores ornementées.
Habitat
On trouve cette espèce principalement dans le sol, les plantes et les végétaux.
Elle est surtout décrite en Nouvelle Zélande et en Australie.
Le mode de contamination est mal connu.
Pouvoir pathogène
Espèce non décrite en pathologie humaine.
Elle est cependant responsable d'avortement chez la vache.
Observations provenant de Grande Bretagne, d'Australie et de Nouvelle-Zélande. Culture poussant bien à 37°C. Aspect clairsemé.
Caractères culturaux
Couleur gris-brun ou blanchâtre.
Température maximale de pouse : 48°C.
- Sporangiophores ramifiés donnant naissance à des sporanges
(20 à 50 µm de diamètre), collerette arquée, marquée, columelle atrophiée.
- Rhizoïdes présents mais difficiles à voir.
- Sporangiospores lisses, cylindriques à réniformes de 4 à 12 µm de long.
Diagnostic différentiel
Mortiellera polycephala dont les sporangiospores sont plus volumineuses
(11 µm de large) et plus ovoïdes et globuleuses.
7 Mucor hiemalis
Zygomycète de l'ordre des Mucorales,
appartient à la famille des Mucoraceae
Index de mycologie
Caractéristiques
sans apophyse.
Columelle globuleuse, lisse ou spiculée.
Spores ou sporangiospores lisses ou ornementées.
Habitat
Champignon cosmopolite, saprophyte du sol, retrouvé sur des substrats variés :
végétaux et matières organiques en décomposition, fruits, grains stockés.
Pathogénicité
Pathogénicité discutée, contaminant de culture fréquent.
Exiger un examen direct et (ou) une histologie positive.
Caractères culturaux
Ce n'est pas une espèce thermophile.
Il repose sur :
- l'examen direct et la culture des prélèvements biologiques
- l'examen direct est capital pour affirmer la nature fongique de la lésion :
filaments mycéliens courts, peu ramifiés, larges (5 à 15 µm de diamètre),
non cloisonnés, irréguliers.
Recherche de filaments larges, irréguliers, peu ou pas septés,
de diamètre 10 à 20 µm,
à paroi épaisse avec parfois des ramifications à angle droit,
au sein d'une réaction inflammatoire et granulomateuse avec atteinte vasculaire
(thrombose).
Colonie expansive, grise, jaunâtre devenant brunâtre.
Température optimum de pousse : 25 à 30°C ++ et température maximale : 32 à 34°C.
Quelques souches poussent à 36-37°C.
La sporulation en général s'arrête au-dessus de 30°C.
- Sporangiophores hyalins, avec branchement en cyme
(les sporanges sont orientés vers l'extérieur) ou en sympode.
- Petit rétrécissement du sporangiophore juste sous le sporange.
- La columelle est lisse, globuleuse à piriforme, parfois d'aspect tronqué.
9 Mucor ramosissimus
Zygomycète de l'ordre des Mucorales,
appartient à la famille des Mucoraceae.
Index de mycologie
Description
Pas de stolons, ni rhizoïdes bien différenciés.
Sporangiophores issus le plus souvent du thalle végétatif, simples ou branchés.
Sporanges globuleux sans apophyse.
Columelle ovoïde, spores (sporangiospores) lisses ou ornementés de spicules.
Habitat
Champignon cosmopolite, saprophyte du sol, retrouvé sur des substrats variés :
végétaux en décomposition, fruits, grains stockés, etc ...
Pouvoir pathogène
Rarement pathogène, affection cutanée et sous-cutanée, atteinte rhinocérébrale,
arthrite septique (pousse mal à 37°C).
Diagnostic
Il repose sur :
- l'examen direct et la culture des prélèvements biologiques
(produits d'expectorations, LBA, sérosités, pus de lésions cutanées,
biopsies tissulaires, etc ...).
L'examen direct est important pour affirmer la nature parasitaire de cette mycose.
Au sein d'une réaction inflammatoire, granulomateuse avec nécrose
et atteinte vasculaire on retrouve des filaments larges, irréguliers,
peu septés, à paroi souvent épaisse (5 à 20 µm de large) avec des ramifications
se formant parfois à angle droit.
Température optimum de pousse : 30°C.
Culture rapide, extensive, aérienne;
de couleur cannelle devenant en vieillissant gris-olive.
Maximum thermique : 36°C.
Sporangiophores hyalins pouvant atteindre 2 mm de haut.
Ils sont finement rugueux.
Ils donnent naissance à des branches secondaires plus courtes,
organisées en sympodes.
Sporocystes globuleux de 15 à 80 µm de diamètre.
Columelle aplatie, souvent absente.
10 Mucor circinelloïdes
Zygomycète de l'ordre des Mucorales,
appartient à la famille des Mucoraceae.
Index de mycologie
Description
Pas de stolons, ni rhizoïdes bien différenciés.
Sporangiophores issus le plus souvent du thalle végétatif, simples ou branchés.
Sporanges globuleux sans apophyse.
Columelle globuleuse, lisse ou spiculée.
Spores ou sporangiospores lisses ou ornementées.
Habitat
Champignon cosmopolite, saprophyte du sol, retrouvé sur des substrats variés :
végétaux en décomposition, fruits, grains stockés.
Pouvoir pathogène
Rencontré en pathologie animale (bovins, porcs), il est plus rare chez l'homme
et survient en cas d'immunodépression sévère,
d'atteinte cutanée suite à un traumatisme ou lié à un cathéter.
La localisation viscérale est plus rare.
Diagnostic
Il repose sur :
- l'examen direct qui affirme la nature fongique de l'infection :
mise en évidence de filaments mycéliens courts,
larges peu ou pas septés de 10 à 20 µm de diamètre,
à paroi irrégulière avec parfois branchement à angle droit.
- la culture.
Au sein d'une réaction inflammatoire et granulomateuse,
mise en évidence de filaments larges, irréguliers, peu septés,
à paroi souvent épaisse, de diamètre : 5 à 20 µm,
parfois ramifications à angle droit.
Pousse sur milieu de Sabouraud entre 25 et 30°C.
Température optimum de pousse : 37°C.
Colonies extensives, rapides, floconneuses, de couleur grise, jaune sale.
- Sporangiophore présentant deux types de ramifications
ou branchements secondaires :
* des grandes assez droites
* des plus courtes souvent courbées
Ces ramifications sont disposées en sympode
- Sporanges globuleux de 20 à 80 µm de diamètre
- Columelle peu visible.