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Glossaire

Index de mycologie

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Geotrichum capitatum

Synonymes : Trichosporon capitatum,
Blastoschizomyces capitatus.
Geotrichum capitatum est une levure de la classe des Endomycètes
qui a longtemps été classé dans le genre Trichosporon.

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Description

Colonies blanches, levuriformes ou légèrement duveteuses.
Les filaments se désarticulent par schizolyse, en donnant des chaînes d’arthroconidies, unicellulaires,
à paroi lisse, de forme arrondie à cylindrique et de taille variable.
Les arthrospores peuvent être présents.

habitat

Levure retrouvée dans la nature et les aliments.
Chez l'homme elle est parfois présente au niveau bronchique.

Pouvoir pathogène

Rarement impliqué en pathologie,
c'est un opportuniste qui peut provoquer chez l'immuno-déprimé des infections profondes
(endocardites, encéphalites, ostéomyélites).

Diagnostic

Il repose :
- sur l'examen direct qui montre des arthrospores.
- sur l'examen anatomo-pathologique.
- sur la culture qui pousse lentement et de façon réduite.
- sur la présence d'arthrospores non bourgeonnantes.

Cet examen est nécessaire car il s'agit d'une levure habituellement saprophyte.
Colonies de pousse réduite, blanchâtres.
Présence de mycélium se ramifiant de façon dichotomique ou trichotomique,
les filamentssecondaires sont disposés à angles aigüs.
Les arthrospores sont terminales ou intercalaires à apex arrondi
et à base applatie, de forme ovoïde (7 à 10 µm sur 2,5 à 3,5 µm).

- Sensibilité à l'Actidione variable.
- Assimilation et fermentation des sucres négatives,
uréase (-), test à l'arbutine (-).
- Thermophilie : température de pousse supérieure à 40 °C.

Diagnostic différentiel

Avec les espèces du genre Trichosporon [arthrospores bourgeonnantes et uréase (+) ]
et une espèce proche Geotrichum clavatum qui est cellobiose (+), arbutine (+).

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Gliocladium sp.

Hyalohyphomycète.

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Description

Colonie à pousse rapide, veloutée à duveteuse,
blanche au départ puis devenant rose à saumon puis vert foncé
lorsque les conidies se forment.
Les conidiophores sont ramifiés en forme de pinceaux.
Les conidies sont unicellulaires, blanche.

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Graphium

Dématiée - Phaeohyphomycète.

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Description

Le genre Graphium est caractérisé par la formation de synnemas (corémies),
il s’agit de regroupement de conidiophores pigmentés qui sont collés les uns aux autres
par un ciment, formant des conidies à leur extrémité terminale.

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Malbranchea sp.

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Description

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Paecilomyces lilacinus


Il appartient à la classe des Deuteromycotina.
C'est un hyphomycète clair : hyalohyphomycète.

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Description

Colonies à pousse habituellement rapide, blanches, jaunes,
brunes ou autres couleurs (vert, violet).
Conidiophores isolés ou en verticilles portant directement des phialides
à base large, à col long, ou par l’intermédiaire de branches
dont sont issues les spores.

Habitat

Cosmopolite, saprophyte du sol et des végétaux en décomposition.
C'est un thermophile qui peut pousser jusqu'à 50°C.
On le retrouve sur de nombreux substrats :
papier, tissus, végétaux, céréales, aliments en conserve, etc ...

Pouvoir pathogène

Rarement pathogène chez l'homme, il est incriminé dans certaines kératites,
endophtalmies dues à la souillure de lentilles de contact,
mais aussi sinusites et atteintes profondes
(abcès cérébraux, septicémies à partir de cathéters ...)
chez l'immunodéprimé.

Diagnostic

- Examen direct : filaments hyalins septés à bords parallèles.
- Cultures sur milieu de Sabouraud avec ou sans Actidione.
Filaments mycéliens dans les tissus.
Eléments plus ou moins déformés, arrondis.

Culture sur milieu de Sabouraud à 37°C.
Croissance rapide, s'étalant sur la gélose, duveteuse à cotonneuse.
Culture blanche au début devenant rapidement rose lilas au recto.
Sur milieu de Czapek, le champignon prend sa couleur caractéristique violacée.

Filaments mycéliens (2,5 µm à 4 µm).
Conidiophores longs (400 à 600 µm) souvent aériens parfois groupés en masse
ou synema pouvant atteindre 2 mm de long,
portant des bouquetsd e 2 à 4 phialides.
Les conidiophores sont échinulés.
Les phialides sont caractériques.

Diagnostic différentiel

Paecilomyces variotii : couleur brune ou brun jaune.
Phialides au col long, présence de chlamydospores.

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Paecilomyces variotii

Il appartient à la classe des Deuteromycotina.
C'est un hyphomycète clair : hyalohyphomycète.

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Description

Colonies à pousse habituellement rapide, blanches, jaunes, brunes ou autres couleurs
(vert, violet).
Conidiophores isolés ou en verticilles portant directement des phialides
à base large, à col long, ou par l’intermédiaire de branches dont sont issues les conidies.

Habitat

Cosmopolite, saprophyte du sol et des végétaux en décomposition.
C'est un champignon thermophile qui se développe jusqu'à 50°C.
Contaminant fréquent de laboratoire, des aliments en conserve (car thermophile)
il dégrade aussi le papier, le cuir, les céréales.

Pouvoir pathogène

Rarement pathogène de l'homme,
il est incriminé dans certaines kératites, endophtalmies, atteintes sinusiennes,
cutanées et parfois aussi profondes (endocardite, encéphalite, pyélonéphrite)
chez les sujets immunodéprimés.

Diagnostic

- Examen direct : filaments mycéliens septés, hyalins.
- Culture sur milieu de Sabouraud avec ou sans Actidione.

Filaments mycéliens avec éléments plus ou moins déformés dans les tissus.
Culture sur milieu de Sabouraud sans Actidione.
Croissance rapide, aspect poudreux, plus ou moins poudreuses ou duveteuses
avec des mèches mycéliennes blanchâtres.
Couleur brun pâle au brun jaune à olive.
Revers jaunâtre à brun foncé.
Peut pousser jusqu'à plus de 40°.

Filaments hyalins de 3 à 5 µm de large.
Conidiophores (30 à 90 µm sur 3 à 7 µm).
Se ramifient en verticilles plus ou moins irrégulièrement.
Chaque branche du conidiophore porte 2 à 7 phialides.
Certaines phialides sont solitaires, le long des hyphes.

Diagnostic différentiel

Paecilomyces lilacinus : couleur lilas.
Phialides au col plus court et absence de chlamydospores.

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Scopulariopsis brevicaulis

C'est un Hyphomycète dont la forme sexuée est connue,
elle appartient à la classe des Ascomycètes,
genre Microascus.

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Description

La cellule conidiogène est une phialide un peu particulière :
chaque spore nouvellement formée (basipètale) laisse une cicatrice sur la phialide
sous forme d’un anneau.
Cet anneau n’est visible qu’en microscopie électronique.
Les phialides sont regroupées.

Habitat

Champignon cosmopolite, vivant dans le sol et de substrats organiques variés en décomposition
(bois, graines, fruits mais aussi produits laitiers, carnés).

Pouvoir pathogène

Agent classique d'onychomycoses à moisissures.
On rapporte aussi chez l'immunodéprimé des formes viscérales profondes
(atteintes pulmonaires, péritonites ...).

Diagnostic

- Examen direct : filaments mycéliens arthrosporés dans les lésions, notamment les fragments d'ongles.
Il n'est pas rare de voir des amas de spores arrondies en forme d'ampoule électrique.
- Histologie si possible, en particulier pour les onychomycoses.

Filaments mycéliens arthrosporés plus ou moins vésiculeux au sein des tissus.
Pousse entre 25 et 27°C.
Culture extensive, rapide sur milieu de Sabouraud sans Actidione (plus tardive avec Actidione), culture plane, poudreuse, plissée au centre,
couleur brune (brun noisette) à l'endroit et brun miel au revers.

A 37°C, la croissance est faible.

Filaments mycéliens de 3 à 5 µm de large.
Les structures conidiogènes (annellides) restent soit isolées sur les filaments,
soit groupées et portées par 2 ou 3 courts conidiophores (aspect ramifié).
Les annellides sont cylindriques avec une partie basale.

Diagnostic différentiel

Scopulariopsis flava : mais ce dernier reste de couleur blanche.
Scopulariopsis asperuta : les colonies sont plus foncées et leurs aspérités plus prononcées.
Scopulariopsis koningii : les conidies restent lisses
et la partie apicale annellée sur l'annelide.

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Scopulariopsis brumptii

C'est un Hyphomycète
dont la forme sexuée appartient aux Ascomycètes,
genre Microascus.

Index de mycologie

Description

La cellule conidiogène est une phialide un peu particulière :
chaque spore nouvellement formée (basipétale) laisse une cicatrice sur la phialide sous forme d’un anneau.
Cet anneau n’est visible qu’en microscopie électronique.
Les phialides sont regroupées.

Habitat

Champignon du sol, végétaux en décomposition, cosmopolite.

Pouvoir pathogène

Rares atteintes pulmonaires chez l'immunodéprimé.
Culture plus lente, modérément expensive.
Reste grise ou gris souris.

- Filament brun foncé de 2 à -3 µm de large.
- Conidiophores courts non ramifiés.
- Annellides isolées ou groupées par 2 ou 3 en forme de bouteille trapue (5 à 10 µm sur 2,5 à 3,5 µm).
Les zones annellées au sommet sont difficiles à voir.
Les conidies sont foncées.

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Scopulariopsis candida

Hyphomycète appartenant à la classe des Ascomycètes,
ordre des Microascus.

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Description

La cellule conidiogène est une phialide un peu particulière :
chaque spore nouvellement formées (basipétale) laisse une cicatrice sur la phialide
sous forme d’un anneau.
Cet anneau n’est visible qu’en microscopie électronique.
Les phialides sont regroupées.

Habitat

Champignon cosmopolite, plus rare cependant que S. brevicaulis.
Isolé du sol, des produits laitiers, du papier, du riz, du fromage.

Pouvoir pathogène

Incriminé dans des intoxications alimentaires à grains moisis.
Le pouvoir pathogène de nature parasitaire ou opportuniste chez l'homme est absent ou rarissime,
(rare atteinte unguéale).

Diagnostic

Indispensable pour affirmer la nature parasitaire.
Croissance rapide à 25-30°C inhibée par une température supérieure à 37°C.
Pousse bien sur milieu de Sabouraud avec Actidione.
Les colonies sont velouteuses à poudreuses,
blanches avec formation parfois de mycélium aérien blanc et stérile.
Le revers est coloré faiblement.

Filaments mycéliens hyalins de 2 à 3 µm de diamètre.
Les conidiophores sont courts, peu ramifiés (5-15 µm sur 2-3 µm).
Les annellides de 10 à 25 µm de long sont soit solitaires,
soit organisées par petits groupes de 2 ou 3.
Elles sont cylindriques produisant des bourgeonnements.

Diagnostic différentiel

Ressemble à S. fusca car chez cette espèce,
les conidies sont aussi lisses mais les colonies et les conidies sont colorées en brun foncé.

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Scopulariopsis koningii

Hyphomycète appartenant à la classe des Ascomycètes, ordre des Microascus.

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Description

La cellule conidiogène est une phialide un peu particulière :
chaque spore nouvellement formées (basipétale) laisse une cicatrice sur la phialide
sous forme d'un anneau.
Cet anneau n'est visible qu'en microscopie électronique.
Les phialides sont regroupées en chapelet.

Habitat

Champignon isolé du sol et aussi de l'atmosphère.

Pouvoir pathogène

Non connu comme agent de mycoses.

Diagnostic

Pousse bien sur milieu de Sabouraud avec Actidione à 25-30°C.
Croissance ralentie à 37°C.
Pousse rapide, s'étale sur la gélose volontiers.
La colonie est poudreuse, à centre surélevé, beige clair,
ressemble à Scopulariopsis brevicaulis avec une périphérie moins marquée.

Filaments mycéliens de 2-3 µm de large.
Les conidiophores s'organisent en longs pinceaux asymétriques
et s'élèvent directement sur les hyphes végétatifs.
Les annellides cylindriques (10 à 30 µm sur 3 à 5 µm)
présentent une zone apicale annellée très allongée.

Diagnostic différentiel

Avec S. candida car les conidies restent lisses,
mais pas d'apex marqué et la colonie macroscopiquement reste de couleur blanc cassé.

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