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Glossaire

Index de mycologie

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Cladosporium carrionii

Actuellement rebaptisé dans le genre Cladophialophora (de HOOG),
il serait assimilé à un Ascomycète,
appartenant à l'ordre des Dothideale.

Index de mycologie

Description

Colonies veloutées ou poudreuses, de couleur foncée.
Mycélium pigmenté.
Les conidiophores sont plus ou moins distincts du mycélium, ils sont simples ou ramifiés,
parfois à croissance sympodiale, geniculés ou non.
Les conidies sont unicellulaires ou multicellulaires.

Habitat

Cosmopolite mais prédominant dans les zones à chromomycose : région tropicale et équatoriale.
Retrouvée chez les ruraux adultes.
Evolution lente.
A Madagascar, c'est dans le sud de l'ile, région plus sèche,
caractérisée par une végétation constituée d'épineux.

Pouvoir pathogène

Un des agents de la chromomycose.
Localisation dermo-hypodermique.
Kystes phaeohyphomycosiques parfois.

Diagnostic

- Grattage des lésions cutanées, biopsie.
- Eexamen direct dans le chloral lactophénol ou la potasse à 10 %.
Mise en évidence des formes parasitaires communes à tous les agents de chromomycoses :
les cellules fumagoïdes.
Eléments de 4 à 12 µm de diamètre.

Rechercher les cellules fumagoïdes au sein des lésions histologiques
où l'on observe une hyperkératose orthokératosique avec hyperacanthose et papillomatose.
On retrouve habituellement le nodule mycosique
au centre duquel on objective les cellules fumagoïdes.

Culture 30 °C, maximum 37 °C.
Colonies de couleur foncée, brun-noir parfois gris vert à olive ou violacé.
Modéremment extensive, elles deviennent poudreuses.
Filaments de 4 µm de diamètre.
Longues chaînes de conidies issues soit d'un filament soit du sommet de l'hyphe végétative.
Les conidies sont ovales, de taille identique pour une même chaîne,
de 2 à 7 µm de long sur 1,8 à 4 µm de large.
- éthanol (+), citrate (-).

Diagnostic différentiel

- Fonsecaea compacta
- Fonsecaea carrionii
( 2 autres agents des chromomycoses).

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Coccidioïdes immitis

Ancienne classification : Hyphomycète
Deuteromycète
Monilliaceae.

Description

Actuellement serait proche ou assimilé à un Ascomycète,
ordre des Onygénales,
famille des Onygenaceae (analyse du DNA ribosomial).

Colonies à pousse rapide, glabres à duveteuses,
de couleur blanche à grise devenant plus foncée.
Pousse à 27°, filament à angles droits.
Formation d'arthroconidies hyalines courtes ou unicellulaires
à forme cylindrique à paroi lisse et assez épaisse (3 à 8 µm).

Habitat

Vit principalement dans le sud ouest des Etats-Unis
(Nouveau Mexique, Californie, Névada, Arizona), au nord ouest du Mexique,
dans les zones sèches du Guatemala, Honduras, Argentine.
Ce sont des régions au climat sec et désertique, avec plantes xérophiles.

Pouvoir pathogène

60 % des cas : asymptomatique
40 % des cas : 3 formes principales,
- forme primaire pulmonaire simulant une pneumopathie de type grippal ou une tuberculose.
- forme cutanée (secondaire) avec lésions nodulaires, verruqueuses ou ulcérées.
- s'associe parfois des formes généralisées.

Diagnostic

On recherche les coccidioïdes (forme parasitaire : sphérule)
dans les prélèvements de peau, sérosités, crachats (liquide broncho alvéolaire),
liquide céphalo rachidien, urines, pus,
biopsies de tissus et/ou d'organes profonds tels que moelle osseuse, ganglions.

Lésions granulomateuses au sein desquelles sont mises en évidence des sphérules
visibles à l'hématoxyline éosine safran,
dans des réactions nécrotiques et suppurées.

Cultures sur milieu de Sabouraud avec ou sans actidione,
à 25-27 °C, en 3 à 5 jours.
Pousse rapide de colonies duveteuses, cotonneuses, blanchâtres au début,
devenant grisâtres puis brunâtres.

Attention DANGER.
Champignon à manipuler obligatoirement sous hotte de sécurité.

C'est un arthrosporé: on visualise des filaments mycéliens septés hyalins
à l'intérieur desquels s'individualisent des arthrospores de 4 à 6 µm de long
sur 3 à 4 µm de large.

Description de la forme parasitaire :
obtenue soit directement des lésions du patient,
soit après passage chez l'animal,
ce sont des éléments arrondis à paroi épaisse de 10 à 80 µm de diamètre,
à l'intérieur desquels s'individualisent des endospores.

Intradermoréaction à la coccidioïdine et à la sphéruline.
Risque de réactions croisées avec Histoplasma capsulatum.
Intérêt en épidémiologie et non en diagnostic.
Un test cutané qui se négative est de mauvais pronostic.

Sur sérum : immuno diffusion (Ouchterlini).
Détection d'antigènes circulants sang, urine, liquide céphalo-rachidien,
par Elisa.

Les sphérules peuvent être confondues avec les adiaspores (Adiaspiromycose)
et avec les sporanges de la Rhinosporidiose
(plus grosses de 50 à 500 µm avec des endospores de 7 à 9 µm).

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Conidiobolus coronatus

Description

Thalle filamenteux.
Filaments de large diamètre (5 - 9 µm), rarement septés.
Présence de sporophores ou conidiophores allongés
donnant naissance à une spore sphérique à piriforme de grande taille
(15 µm sur 40 µm) avec une papille basale conique de 2 µm de diamètre.

Habitat

Les conidiobolus sont retrouvés dans le sol, sur les végétaux en décomposition.
C'est un saprophyte de l'humus et du terreau.
Si leur distribution est cosmopolite,
la maladie est surtout décrite dans les régions tropicales chaudes et humides.

Pouvoir pathogène

Agent de la Rhinophycomycose.
La maladie sévit à l'âge adulte.
Suite à son introduction par voie nasale,
le champignon se développe en formant un granulome muqueux endo-nasal
qui va progressivement envahir les sinus, le pharynx mais aussi les poumons,
les ailes du nez.

Diagnostic

Repose sur l'examen direct et sur l'examen anatomo-pathologique.
Biopsies des lésions.

Examen direct : filaments larges coenocytiques de 8 à 20 µm de diamètre,
(coloration à l'HES) fragments d'hyphes mycéliens de 8 à 20 µm
entourées d'un halo éosinophile et autour une infiltration cellulaire
riche en lymphocytes et en histiocytes.

Des micro abcès et des cellules géantes sont aussi présentes.
La réaction fibreuse est extensive.

Culture sur milieu de Sabouraud sans Actidione,
la croissance est rapide surtout à 37 °C.
Les colonies sont plates, glabres
puis deviennent plissées et poudreuses avec l'âge.
Couleur blanchâtre devenant brunâtre en vieillissant.
Revers chamois.

Filaments mycéliens larges de 8 à 20 µm peu cloisonnés.
Conidiophores cylindriques portant des conidies solitaires (ou macroconidies)
subglobuleuses, lisses, de 25 à 45 µm de diamètre, éjectables,
avec une papille basale proéminente.

Diagnostic différentuel


- Basidiobolus sp.
- Conidiobolus incongrus : ce dernier est rare mais pathogène
(atteinte profonde).
Se différencie par l'absence de spores villeuses
et la présence de zygospores à double paroi épaisse (ou azygospores).
La croissance est encore plus rapide.

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Conidiobolus incongrus

Index de mycologie

Description

Thalle filamenteux.
Filaments de large diamètre (5 - 9 µm), rarement septés.
Présence de conidiophores allongés donnant naissance à une spore sphérique
ou piriforme de grande taille (15 µm sur 40 µm)
avec une papille basale conique de 2 µm de long.

Habitat

C'est un champignon du sol, affectionnant les débris végétaux,
retrouvé en Asie et en Amérique.

Pouvoir pathogène

Mode de contamination : mal connu, par traumatisme, par voie aérienne peut-être.
Rare pathogène.
Moins de 5 observations publiées à ce jour.
Une atteinte pulmonaire chez un enfant de 15 mois en Virginie (Etats-Unis),
2 formes disséminées touchant 2 femmes thaïlandaires.

Diagnostic

Repose sur l'examen direct et sur l'examen anatomo-pathologique.
Biopsies des lésions.
Examen direct : filaments larges coenocytiques de 8 à 20 µm de diamètre.
Après (coloration à l'HES) fragments d'hyphes mycéliens de 8 à 20 µm
entourées d'un halo éosinophile et autour une infiltration cellulaire
riche en lymphocytes et en histiocytes.
Des cellules géantes et des micro abcès sont aussi présents.
La réaction fibreuse est importante.

Culture sans Actidione. A 37 °C.
Colonies planes blanchâtres, expansives devenant plissées avec l'âge.

Diagnostic différentiel

Proche de Conidiobolus coronatus.
Filaments mycéliens larges (5-9 µm de diamètre), peu septés, à paroi épaisse.
Conidiophores donnant naissance à des macroconidies : macroconidies primaires (20 à 40 µm)
éjectables, avec une papille basale.

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Exophiala dermatidis

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Description

Colonie à pousse réduite.
Aspect levuriforme tout d’abord puis devenant duveteux, noir verdâtre.
Présence de cellules conidiogènes, intercalaires ou isolées
en forme de bouteille ou en forme effilée;
avec parfois à l’extrémité terminale des cicatrices en incrustation.

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Exophiala jeanselmei jeanselmei

Selon l'ancienne classification : Deutéromycète Hyphomycète noir (Dematiaceae).
Actuellement serait assimilé aux Ascomycètes,
à l'ordre des Dothidéales
et à la famille des Herpotrichiellaceae.

Index de mycologie

Description

Colonie à pousse réduite.
Aspect levuriforme tout d’abord puis devenant duveteux, noir verdâtre.
Présence de cellules conidiogènes (annelides),
intercalaires ou isolées en forme de bouteille ou effilée;
avec parfois à l’extrémité terminale des cicatrices.

Habitat

Champignon issu des sols enrichis en matières organiques ou de végétaux en décomposition.

Pouvoir pathogène

Cosmopolite (++), la contamination habituelle se fait par voie transcutanée (blessure,
traumatisme, écharde ...).
- Agent de mycétome,
- de kystes phaeohyphomycosiques sous-cutanés,
- d'abcès ou d'ulcère, parfois de sinusites,
- plus rarement de formes viscérales profondes (reins, système nerveux central)
chez le sujet immunocompromis.

Diagnostic

A partir de prélèvements : ponction de kystes, biopsies,
analyse du grain, des sérosités, du pus.

- Etat frais, frottis sur lame, apposition : examen direct ++ et coloration MGG-Grocott.
- Culture sur Sabouraud chloramphénicol avec ou sans Actidione à 25°.

Eléments levuriformes et filaments arthrosporés bruns dans les tissus,
dans les lésions de phaeohyphomycoses, au sein d'un granulome inflammatoire ou de microabcès.

Colonies de croissance lente d'abord humide, lisse, glabre, de couleur gris vert à noir;
puis secondairement, la colonie devient duveteuse (d'aspect grisâtre)
correspondant à un mycélium aérien, abondant.
Le montage fait apparaître de nombreuses levures noires parfois groupées en amas
le long des filaments.
Les cellules conidiogènes sont en forme de bouteille, leur sommet est pointu,
discrètement annelé (ou annellides) souvent difficile à voir.

Diagnostic différentiel

Assimile le nitrate de potassium et le melézitose,
contrairement à Wangiella dermatitidis.
- Exophiala spinifera.

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Exophiala spinifera

Classiquement appelé Hyphomycète Deutéromycète Dematiaceae.
Actuellement serait assimilé aux Ascomycètes,
à l'ordre des Dothidéales
et la famille des Herpotrichiellaceae.

Index de mycologie

Description

Colonie à pousse réduite.
Aspect levuriforme tout d’abord puis devenant duveteux, noir verdâtre.
Présence de cellules conidiogènes (annelides),
intercalaires ou isolées en forme de bouteille ou en forme effilée;
avec parfois à l’extrémité terminale des conidies.

Habitat

Cosmopolite, décrit en Asie, sur le continent américain.
Issu du sol, a été isolé chez le poisson.
Il est inoculé à partir d'une piqûre.

Pouvoir pathogène

Lésions cutanées : abcès, ulcères,
- kystes sous cutanés phaeohyphomycosiques,
- sinusites.
- Plus rares : atteintes systémiques et chromomycose.

Diagnostic

Prélèvements : biopsie, ponction d'abcès, de kystes sous cutanés, de lésions profondes.
Examen direct état frais : fragment de mycélium épais, arthrosporé, foncé.
Culture sur Sabouraud: entre 25 et 30°C.

Levures et filaments bruns dans les tissus.
A 30°C sur Actidione.
Colonies d'expansion réduite, foncées, noir olives, lisses, glabres au centre.
Après 3 à 4 semaines, elles se recouvrent d'un duvet gris foncé, surtout en périphérie.

Filaments mycéliens arthrosporés souvent foncés
sur lesquels se dressent des conidiophores multi septés.
La dernière cellule (annelide ou conidiophore) se termine en pointe aiguille,
terminée par de fins anneaux : taille 1 à 2,5 µm à la base sur 2 à 100 µm.
Uréase +.
N'hydrolyse pas la caséine.
Assimile la D-glucosamine, le lactose, le L-arabinitol, le DL-lactate et le citrate.

Diagnostic différentiel

- Exophiala jeanselmei - Exophiala pisciphila.

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Fonsecaea pedrosoi

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Description

Colonie de pousse réduite veloutée à cotonneuse de couleur noir verdâtre.
Les conidiophores, peu différenciés,
présentent de petites cicatrices à leur extrémité terminale.
Ils forment des conidies unicellulaires isolées (radulospores) ou en chaînes formée.

Habitat

Prédomine dans les régions tropicales humides
et en particulier dans une végétation de forêt dense.
A été isolé du sol ainsi que d'animaux à sang froid.
Mode de contamination: traumatisme, blessure d'origine tellurique.

Pouvoir pathogène

Agent de chromomycose.
Parfois retrouvé dans des lésions de sinusite.
Atteint rarement les organes profonds (Phaeohyphomycoses).

Diagnostic

- Prélèvement : squames, peau, biopsie, ...
- examen direct sur squames, croûtes, sérosités, ...

Produit pathologique éclaircit dans la potasse à 30 %
permet de visualiser les cellules fumagoïdes.
Eléments de 4 à 12 µm de diamètre groupés en amas muriformes.

Habituellement la lésion histologique est caractéristique.
On observe une hyperkératose orthokératosique avec hyperacanthose et papillomatose.
On retrouve le nodule mycotique au centre duquel on met en évidence les cellules fumagoïdes.

Culture extensive, laineuse, duveteuse, de couleur olive à gris souris et noire au verso.
Selon les souches, car c'est un champignon assez polymorphe,
on peut obtenir 3 types de fructification :
1 - phialides à colerettes de 8 à 12 µm portant en surface 1 à 8 spores, groupées.
2 - formes cladosporium courtes ou hormodendron courtes
3 - formées caractéristiques.

Diagnostic différentiel

- Fonsecaea compacta
- Cladosporium carrionii.

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Fonsecaea compacta

Index de mycologie

Description

Colonie de pousse réduite veloutée à cotonneuse de couleur noir verdâtre.
Les conidiophores, peu différenciés,
présentent de petites cicatrices à leur extrémité terminale.
Ils forment des conidies unicellulaires isolées (radulospores)
ou en chaînes formées.

Habitat

Prédomine dans les régions tropicales humides : en Amérique latine et en Asie.
Espèce trouvée également en Europe.
Mode de contamination : par traumatisme, blessures telluriques (végétal, écharde, épine,...)

Pouvoir pathogène

Agent de chromomycose.
- Prélèvements : squames, peau, biopsie, ...
- examen direct sur squames, croûtes, sérosité.
Le produit pathologique éclaircit dans la potasse à 30 %
et permet de visualiser les cellules fumagoïdes.
Ce sont des éléments de 4 à 12 µm de diamètre, groupés en grappes.

Biopsie.
On observe habituellement une hyperacanthose orthokératosique
avec hyperacanthose et papillomatose.
Au centre des nodules mycotiques,
on peut mettre en évidence les cellules fumagoïdes caractéristiques.

Culture à 30 °C,
colonies à croissance toujours lente, peu développées.
Au début glabre, plane puis duveteuse, poudreuse, de couleur noir olive.
Le verso est noir.
Filaments mycéliens donnant naissance à des conidiophores courts peu différenciés,
mais très ramifiés, à l'aspect en buissons.
A l'extrémité, les cellules conidiogènes ellipsoïdes de taille variable donnent naissance
à des chaînes (courtes) de conidies.

Diagnostic différentiel

- Fonsecaea pedrosoi.

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Histoplasma capsulatum capsulatum

Ajellomyces capsulatus (KWON-CHUNG en 1972)

Index de mycologie

Description

Champignon dimorphique ayant une forme levure dans les tissus ou en culture à 37°,
et une forme filamenteuse dans le sol ou sur les cultures à la température de 27 à 30° C.

Les colonies poussent lentement,
elles sont blanches à brun beige, duveteuses.

Habitat

Champignon du sol, de préférence acide, enrichi en matières organiques
(fientes d'oiseaux, plus particulièrement de pigeons, de poulets,
d'étourneaux et de guano de chauves-souris).
Cosmopolite.

Pouvoir pathogène

- forme primaire pulmonaire avec adénopathies hilaires et médiastinales.
- forme secondaire généralisée (plus grave, en particulier chez le VIH)
avec hépatosplénomégalie, adénopathie, ulcérations buccales (voile du palais, lésions pharyngées).
Atteintes généralisées possibles.

Diagnostic

- Prélèvements au niveau lésionnel : peau, muqueuse, crachats, liquide broncho-alvéolaire,
moelle osseuse, biopsie des lésions buccales ou d'organes profonds (foie, ganglion ...).

- Examen direct sur frottis ou apposition de biopsies sur lame, fixation, coloration.
Mise en évidence de petites levures de 3 à 5 µm de long, intracellulaire, Gomori-Grocott (+++).

Diagnostic différentiel : Leishmanies et Penicillium marneffei.

Selon l'état immunitaire du patient, on distingue 2 formes polaires caractéristiques
(histiocytaire et diffuse).

Cultures duveteuses, blanchâtres au début devenant brunes ensuite.
Les cultures sont dangereuses, à proscrire en dehors d'une hotte de sécurité.
Le laboratoire doit être averti de la possibilité d'une histoplasmose.

A 25 °C étuve humide (humidité 100 %).
- filaments mycéliens de 2 à 5 µm de diamètre, septés et ramifiés.
- aleuriospores de petites tailles (microconidies) arrondies ou piriformes de 2 à 3 µm de long.
- spores de plus grande taille de 8 à 12 µm de diamètre.

Obtention de la forme levure (difficile sur Brain heart infusion agar)
ou aussi in vitro à 37 °C dans une étuve à 5 - 10 % de CO2
sur un milieu à base de sang, peptone, cysteine Ph4.
Il faut repiquer tous les 4 jours, durée 1 mois.

Inoculation à l'animal;
- intradermo à l'histoplasmine : intérêt pour enquête épidémiologique.
- kit commerciaux HAI, immuno précipitation, immuno fluorescence indirecte
(à valider, intérêt des témoins).
- AIE: arc H (infection aigue), arc M (infection chronique).

Recherche dans les urines en culture sur Sabouraud à 25 °C.
Champignon dimorphique ayant une forme levure dans les tissus in vivo
ou en culture à 37°,
et une forme filamenteuse dans le sol ou les cultures
à la température de 27 à 30°C.