TAXONOMIE ACTUELLE
Développement d'un concept d'espèce.
- S. Aureus ( coagulase POSITIVE )
- Espèces adaptées depuis longtemps à la pathologie humaine
- S. saprophyticus presque le seul à pousser en présence de novobiocine.
- S. epidermidis différencié du genre micrococcus par la fermentation du glucose en anaérobiose.
- Nouvelles espèces en pathologie humaine
- S. haemolyticus
- S. hominis
- S. warneri
- S. capitis
- S. cohnii
- S. xylosus
- S. simulans
- S. lugdunensis
- Espèces nouvellement individualisées pouvant être rencontrées en pathologie :
- S. sciuri
- S. intermedius généralement coagulase Positive.
- S. hyicus coagulase parfois Positive.
La différentiation entre ces deux espèces repose essentiellement sur UREE et Arginine, tous deux positifs pour S. Hyicus. ( Trouvées chez d'autres mammifères et ou des oiseaux.)
- Espèces rarement rencontrées en pathologie humaine, mais fréquentes en médecine vétérinaire :
- S. caprae
- S. carnosus
- S. auricularis
- S. caseolyticus
- S. gallinarum
- S. saccharolyticus
- S. lentus proche ou biovar de S. sciuri
- S. arlettae
- S. equorum
- S. kloosii individualisé par Kloos chez les animaux sauvages.
Toujours identifier à partir d'une souche pure, car les staphylocoques sont très souvent :
- associés à d'autres bactéries
- en populations mélangées.
La différentiation avec le genre MICROCOCCUS ces genres étant CATALASE POSITIVE ( par opposition à la plupart des autres Coques Gram Positif, et en particulier les Strepto.) repose essentiellement sur la croissance en présence de 0,5 mg de bacitracine qui inhibe les Microcoques.
Les Microcoques sont des bactéries donnant des colonies généralement colorées :
- Micrococcus Luteus : pigment jaune _ jaune orange.
- Micrococcus Roseus : pigment orange _ rouge.
- Micrococcus Varians : pigment jaune _ jaune orangé.
L'isolement sur un milieu gélosé permet :
- De récupérer des biovars de pousse faible ou nulle sur milieu hypersalé.
- La mise en évidence très aisée des divers pigments doré, citrin, crème ou blanc.
- De noter son hémolyse s'il y a lieu et son type, hémolyse totale alpha ou gamma hémolyse partielle à limite nette type bêta.
ANALYSE SEROLOGIQUE DES SOUCHES DE STAPHYLOCOQUE
- Pour individualiser les souches de S. aureus isolées chez l'homme.
- Pour caractériser les espèces décrites par Kloos et Schleifer citées ci-dessus.
- Sérotypie par agglutination sur lames des germes testés mis en contact avec des immun sérums absorbés, spécifiques.
- 14 immun sérums absorbés sont disponibles au Centre de Référence des staphylocoques.
Les sérotypes de S. Aureus habituellement rencontrés sont les suivants : - 11-66438 - 111-11/1 - 9-11/1 - 9-11/1-66438 - 18 les immun sérums étant 1,11,111,6,7,9,10,11/1,11/111,14,15,17,18,66438 ce qui montre qu'une même souche peut donner une agglutination avec plusieurs immun sérums.
- Lysotypie Il n'y a pas de corrélation positive entre la sérotypie et la Lysotypie, ces marqueurs épidémiologiques ont un apport complémentaire dans la caractérisation des souches.
- MS Croissance en présence de faible concentration de bacitracine (0,05 mcg/ml). Utilisé pour différencier les staphylo POS des microcoques NEG - NIT.
- Réduction des nitrates en nitrites, streptocoques toujours NEG, staphylo souvent POS - NOV.
- Résistance à de faibles concentrations de novobiocine (1,6 mcg/ml ) caractéristique de S. saprophyticus ; S. xylosus, S. Cohnii, S. sciuri, les autres staphylo sont sensibles à la novobiocine.
- PGR Capacité à synthétiser une glucosidase spécifique, détectée par hydrolyse du complexe carbohydrate/ béta-naphtylamine qui libère du paranitrophénol de couleur jaune.
- IDX hydrolyse de l'indoxyl-phosphate par l'indoxyl-phosphatase entraînant la formation d'un précipité bleu.
- La plupart des staphylo coagulase et dnase POS sont IDX POS.
- VP Acéthylméhylcarbinol produit à partir du glucose.
- OPT Résistance à l'optochine. Staphylo sensibles.
- PHO La phosphatase alcaline hydrolyse le p-nitrophényl-phosphate en phosphate inorganique et en para- nitrophénol de couleur jaune.
- BE Bile-esculine germes capables de pousser en présence de 40 % de bile et d'hydrolyser l'esculine, précipité noir, quelques staphylo sont POS
- PYR La production de pyrrolidonase coupe la L-pyrrolidonyl-B-naphthylamide en L-pyrrolidonyl et en B-naphthylamine qui se combine avec le réactif peptidase (p-diméthyl-aminocinnamaldéhyde) pour former une coloration rouge.
- ARG Déhydrolysation de l'arginine entraînant une alcalinisation du milieu, détectée par le rouge de phénol qui vire du jaune au rouge.
- PGT voir PGR
- URE
- RAF
- LAC
- TRE
- MNS